2012年4月28日土曜日

Genetic Engineering


Genetic engineering
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2012年4月27日金曜日

食物繊維 - Wikipedia


食物繊維(しょくもつせんい)とは、人の消化酵素によって消化されない、食物に含まれている難消化性成分の総称である。その多くは植物性、藻類性、菌類性食物の細胞壁を構成する成分で、化学的には炭水化物のうちの多糖類であることが多い。

従来は、消化されず役に立たないものとされてきた。後に有用性がわかってきたため、日本人の食事摂取基準で摂取する目標量が設定されている[1]。ただし、定義から明らかなように栄養素ではない。

ヒトの消化管は自力ではデンプンやグリコーゲン以外の多くの多糖類を消化できないが、大腸内の腸内細菌が嫌気発酵することによって、一部が酪酸やプロピオン酸のような短鎖脂肪酸に変換されてエネルギー源として吸収される。デンプンは約4kcal/g のエネルギーを産生するが、食物繊維は腸内細菌による醗酵分解によってエネルギーを産生し、その値は一定でないが、有効エネルギーは0~2kcal/gであると考えられている。また、食物繊維の望ましい摂取量は、成人男性で19g/日以上、成人女性で17g/日以上である[1]。食物繊維は、大腸内で腸内細菌によりヒトが吸収できる分解物に転換されることから、食後長時間を経てから体内にエネルギーとして吸収される特徴を持つ。大腸の機能は食物繊維の存在を前提としたものであり、これの不足は大腸の機能不全につながることになる。食物繊維をNSP[2]と呼ぶこともある。

1918年、医師であるジョン・ハーヴェイ・ケロッグは『自家中毒』[3]という著書を出版し、腸内で細菌が未消化タンパク質から作る毒が健康を害するという自家中毒説をもとに、未消化の肉には細菌が繁殖しやすいが、食物繊維は腸を刺激して活発にさせるので毒が作られにくいという理由で菜食をすすめた[4]

しかし、一方で栄養学では「食べ物のカス」ともされ、長年役に立たないものと認識されていた。たとえば、栄養学の創設者である佐伯矩は、玄米は栄養が多いが未消化物が多いので消化吸収の効率が悪いなどとして、ある程度精白した米である七分搗き米をすすめていた[5]

1960年代の南アフリカのジョージ・オットル(George Oettle)が、食物繊維と大腸がんの関連の研究をしていた。1967年に、インドのマルホトラは食物繊維の摂取が多い場合、がんのリスクが減るという報告をしている[6]

2012年4月25日水曜日

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2012年4月24日火曜日

メルクマニュアル家庭版, 炭水化物、タンパク質、脂肪 152 章 栄養の基礎知識


炭水化物、タンパク質、脂肪は食事の乾燥重量の90%を占め、食事から得られるエネルギーの100%を占めます。エネルギー源として、炭水化物、タンパク質、脂肪は、それぞれのエネルギー含有量に応じて、互いに代用することができます。エネルギー含有量は、炭水化物とタンパク質は1グラムにつき4kcal、脂肪は1グラムにつき9kcalです。しかし、エネルギーを供給する速さには違いがあり、炭水化物は最も速く、脂肪は最も遅い速度でエネルギーを供給します。

炭水化物、タンパク質、脂肪は腸で消化され、そこで最も小さな基本単位にまで分解され、炭水化物は糖、タンパク質はアミノ酸、脂肪は脂肪酸とグリセロールになります。体はこれらの基本単位を使って、他の炭水化物、タンパク質、脂肪など、体の成長、維持、活動に必要な物質をつくります。

炭水化物: 炭水化物は分子の大きさによって、単純炭水化物と複合炭水化物に分けられます。単純炭水化物は、ブドウ糖(グルコース)や果糖(フルクトース)をはじめとする各種の糖類です。小さな分子なので体内ですぐに分解され、最もすみやかにエネルギーを供給します。果物、乳製品、はちみつ、メープルシロップには多量の単純炭水化物が含まれており、キャンデーやケーキなどの甘い味のもととなります。

2012年4月22日日曜日

異見あり2005


異見あり2005

2005

 水の底、地の底からフツフツと、こんな見方もあるんだよと現れました。(12/17更新)


<2005年10〜12月>
ああ、代議制/虚報転じて予言と化す?/都市住民のナショナリズム/崩れる/民間開放のアナ/放送とネットの対立/若者気分/温暖化/ブロッコリー/
<2005年7〜9月>
みんな一緒/国民投票/政党ゲーム/巨人よ、ひよわるな/ライフ・イズ・ミラクル/お目こぼし/共通する価値観はあるか/戦争も民営化/夏だ! コブラ祭りだ!/
<2005年4〜6月>
負け戦の責任/戦死者と戦災死者と戦争受難者/写真が語る/検定狂想曲/押し付け牛肉/アジア解放を目指した男たち/中国にも必要な民主主義/やっと「独立」できる?/TVはネットで?/

<2005年1〜3月>
正しい食べ方/東京を捨てた友/存在は空であるか?/それだけで済むのかしら/分裂したって、いいんだよ/通貨と信用/スポーツとなった大相撲/大津波と"地球に優しい"/ニート/国のかたち/



<2005年10〜12月>


ああ、代議制……(12/17)
 主権者の判断で政権を担う政党を交代させることができる制度があっても、主要政党が同じ一色になってしまったならば,実質的に主権者の選挙における選択は不可能となる。現実に置いてきぼりにされた社会党が衰退して以来,自民党批判の主権者の第1の受け皿は民主党だった。その民主党が消えようとしている。消えたって、いいけどね。どうせ半自民党でしかなかったのだから。
 ソ連が崩壊し,中国が市場経済に方向転換して以来,日本国内の"左翼"勢力は急速に力を失った。大規模な反対集会やデモが繰り返されてもおかしくないような法案が国会で審議されていても,反対運動は以前のような規模では行われない。ソ連や中国から"左翼"勢力に資金援助があ ったから、大規模な集会やデモなどができたが,その資金が来なくなってみると,日本人自前の政府批判運動の底の浅さが露呈したという見方がある。まあ、自民党や周辺には以前はアメリカから資金援助があって,日本の経済成長とともに日本の経済界が自前で自民党などを援助することができるようになったのに対し,"左翼"勢力はソ連や中国頼みで日本国内に金ヅルを持たなかったという違いが、現在の有様につながっているのだろうが。
 「自民党と同じなら自民党でいいではないか」と朝日新聞の社説で皮肉られ、中国敵視,アメリカべったりの前原民主党党首は訪中しても三下扱い。「大連立を」なんて自民党から揺さぶりをかけられ,すっかり弄ばれている。
 そんな落ち目の民主党が党大会を開いた。どんなメッ セージが出て来るかと思ったら,前原代表が、小泉のイメージを狙ったのか自説に固執する人物であることが浮き彫りになり,「自分の国,国民に誇りと自信が持て,他国からも一目置かれる国家」になるために「国民が,国が自立しなければいけない」なんて言い出す始末(朝日新聞)。この前原という人は、日本という国に誇りも自信も持っていないらしく、日本が他国から一目置かれる国ではないとも思っているらしい。日本に一目も二目も置いているから中国も韓国も、日本の動向に過剰なまでに反応するという現実の理解さえ満足にできていない。
 前原代表なりに日本の行く末を真剣に考えて「公の精神」や「国の自立」などということを考えたのだろうが(同じようなことを書いていたマンガもあったけどね)、しょせ� �は頭の中ででっち上げた観念でしかない。地に足がついていない。まず現実の中に入って見ること。そこから政治は始まる。それが代議制の基本である。エリート面をした人物の観念を具体化する装置が代議制であっては不毛である。現在の日本社会の現実を人々の間に入って、つぶさに見ることから課題,問題が見えて来る。国のかたちを政治家が主権者に押し付けるのではなく,主権者の思いを政治家が汲み取るようにならなければ、日本の民主主義は衰退するだけである。


虚報転じて予言と化す?
……(12/10)
 【北京=人民月報】社会主義市場経済により人民の間の貧富の差が拡大し,富裕階級・特権階級が形成された中国で,平等を重視する誤った反社会的思想を鼓舞するとしてカール・マ� �クスの著作が06年から発行禁止になる。既発行分についても回収・廃棄が進められる。政府公認の図書館などでの閲覧は可能だが,閲覧には共産党担当部署の許可証が必要になるという。また、体制転覆を煽る過激思想であるとして毛沢東の著作の新規発行停止,閲覧制限も検討されているという。
 【ニューオリンズ=CMM】ハリケーンで水浸しになったことが世界中で報じられた当地では,「水の都」のイメージで観光客を世界から集めようという計画が進んでいる。従来の街並みに復興させることを当初は検討していたが,多額の費用と長い時間がかかる見込みであることと、水面下にある当地では,堤防の補修・強化を進めなければ大型ハリケーン来襲のたびに水浸しになることが必至であることから、「水と生きる」都市へと� �造することを決定。ベネチアをイメージした都市へ変貌させることとなった。建物の防水改築を順次進め、06年中にも堤防に水門を設け,徐々に都市部への注水を開始する予定だ。
 【東京=嫁売新聞】震度5程度で倒壊する可能性のあるマンションからの自主退去を要請した東京都などの各自治体は,ビル・マンション不審ムードを早期に収束させようと担当者の会合を開いた。これは、震度5程度で倒壊するビル・マンションへの居住を認めないという「基準」を設定すると,旧建築基準法時に適法に建築された多くのビルも震度5程度で倒壊する可能性があり,相当数のビル・マンションが「基準」以下となることが判明したため。「基準」を厳格に適用すると膨大なビル・マンションが使用不能となり,社会的な大混乱を招く� �とから,姉歯関係物件だけに問題をとどめることで合意したという。阪神大震災で当時の建築基準法ではビルの耐震強度が不足していることが明らかになり,耐震性を高める方向で建築基準法が改正されたが,それまでに適法に建築されたビルについては放置されている。
 【パリ=ル・モンジャ】厳しい警備のため都市部では下火になった夜間の自動車への放火だが、重点警備の裏をかくように地方への拡散が始まっている。地方の警備を強化すれば手薄になった都市部で再燃しかねず,治安当局は国際イメージにつながりやすい都市部での警備に重点を置くことを決めた。そんなフランスに最近,アメリカからの一風変わった観光客が増えているという。彼らはルーブルなどには行かず,暗くなってからビデオ片手にホテルを出て� ��朝まで帰ってこないという。放火などを見ることができた人たちは上機嫌で、「もっとやれ」などとけしかける人もいるという。アメリカ事情に精通する評論家のモンテ・パパルドゥー氏は「フランスの理念が破綻する様を見て鬱憤を晴らすため米共和党員がやって来ている」と見ている。
 【ロサンゼルス=URI京同】ABCに続きNBCのテレビ番組も「iTMS」で配信を開始(1本1.99ドル)し、好調なダウンロードを得ているアップルコンピュータは、06年中に日本でもテレビ番組の配信を開始する。米NBCでは放映中の番組も放映翌日からダウンロードできるが,日本では人気旧作番組のみの配信からスタートする。番組を提供するのは1、2局に絞られているが,1本300円程度との料金を巡って同意にはまだ至っていない模様。アップルは動画 対応の
iPodの発売に合わせて日本でも「 iTunesミュージックストア」でミュージックビデオの販売を開始しており,テレビ番組配信の準備も進めていた。「ネットと放送の融合」の先を越されたライブドアや楽天はアップルジャパンへの資本参加を打診しているという。

都市住民のナショナリズム……(12/4)
江戸っ子「都市はどのように形成されたか? 三代前のことなら覚えてんが、それより前のことなんざ知らねえ」
酢豆腐 「人が集まって、物流が生まれ、市場が形成され,それが更に人を呼ぶ。地方からの移住者で都市は成長した」
江戸っ子「どうりで半ちくな田舎モンがやたら多いわけだ」
酢豆腐 「で、ナショナリズムの話だが,ナショナリズムの根底にあるのは愛郷心だという説がある。生まれ育った故郷への愛着が、外� ��への防衛心と結びつき、故郷の延長線上にあるものとして自国をとらえナショナリズムが形成されたという考えだ」
江戸っ子「すると、江戸を守ろうという意識が高じて日本全体を守らなきゃならねえという意識になるってわけですかい? 江戸っ子が江戸を守ろうとするのは解りますがね,なんで江戸っ子が,行ったこともないド田舎まで面倒を見てやらなきゃならねえんですかい? ド田舎のことなんざ田舎モンにやらせておけばいいこった。わざわざ出張るほどのことじゃねえ」
酢豆腐 「そうした愛郷心が、統一国家の形成に伴う愛国教育で愛国心に移行させられるんだな。日本だけじゃなくて、どこの国でも同じだ。つまりナショナリズムは,自然な感情をベースに人為的に形成される」
江戸っ子「なんで江戸っ子� �ド田舎まで愛さなきゃならねえのか、そいつが解らねえ」
酢豆腐 「そこに物語が入って来る。共通の感情を持つことができるように、いろいろな物語が吹き込まれるんだな。歴史や自然などがよく使われる。例えば,『偉大な歴史を持つ我が国は…』とか『美しい自然・風土を持つ我が国は…』とか、やたらと大きなものを持ち出して個人を無化しようとする。国家という大きな物語の中に個人を取り込んでしまえば,国家を代表する権力者らは安泰というわけだ」
江戸っ子「どこの国だって,それなりに偉大な歴史があるでしょうし、美しい自然・風土もあるに違えない。大きな物語って言うんだったら、いっそ人類・地球規模で、偉大な歴史であるとか美しい自然であるとか言えばいいんだ。中途半端なところでこだわるこ� �あねえ」
酢豆腐 「その通り。なんだが、あまり対象が大きすぎると個人のほうで自己投影できにくくなるんだな。ナショナリズムが根強いのは,一方的に吹き込まれるだけじゃなくて,個人の方からも国家イメージにすり寄り,『偉大な国家(という物語の中)の一員である』との満足を得たいという欲求があるからだ。自己実現を国家イメージに重ね合わせているという面がある」
江戸っ子「やっぱり半ちくな野郎たちだ。俺は江戸っ子であることだけで、それ以上は必要ねえんだが、ド田舎でも故郷は故郷だろうに,連中は愛郷心だけでは満足できず国家にしがみつき始めてナショナリズムが流行り出したってことですかい?」
酢豆腐 「帰る故郷を持っている都市居住者は多いだろうが,田舎に例えば実家があるとか土 地があるとかで、懐かしさはあっても愛着というほどの強い思いはあるまい。都市居住者に感情としての愛郷心が心に潜んでいても,田舎にも現に住んでいる都会にも向けることができず,国家という物語を愛郷心の対象に見つけて入れあげ始めたというところかもしれない」

崩れる……(11/26)
 フランス各地で起こった自動車への放火などの暴動は、同化主義の限界を示すものととらえられているようだ。一方でロンドンの地下鉄テロが移民二世によるものだったことから、多文化主義にも疑問の目が向けられている。
 この二つ,大いに異なるものであるかのように言われているが、実態は同じである。つまり、移民は低賃金労働者としてしか社会的存在意味がない。奴隷制度ならば人権尊重の理念に� ��するが、自由意思でやってきて低賃金で働いているのだから自己責任だとされる。
 定住した移民にも生活があり人生がある。子供も産まれる。その子が先住の白人と同じ1人のイギリス人,フランス人として社会に受け入れられれば,それぞれの社会的理念を生かすことができたのかもしれないが、「学校は選別の場,行政は失業問題に無策,警察による差別は日常茶飯事」(朝日新聞)だったというから、同化主義も多文化主義も社会を装飾する言葉でしかない。
 欧州では日本同様,人口減少から移民を受け入れて行くことが必要だとされている。しかし、社会の主導権は渡さず、移民もその子孫も不満を持たずにいつまでも低賃金労働に従事していてほしいというのは虫のいい注文だ。欧州の低賃金労働も本国での生活に� ��べれば上等だと実感できる移民一世ならともかく、欧州で生まれ育った移民二世,三世らは、その社会の中での相対的な貧しさに押し込められている自らの境遇に不満を持つ。
 社会内の棄民とされた人びとが異議申し立てを行うのは当然である。民主主義やら人権尊重やらをうたっている社会であるなら異議申し立ては行うべき義務である。多大な犠牲を伴いつつ市民が権利を主張して民主主義を勝ち取った社会は、各人の権利の主張によって受け継がれ支えられる。だが…という言葉が聞こえる。「権利の主張は認めるが,いきなり暴力を用いるのは駄目だ」と。「暴力を用いて問題を顕在化させなければ,聞く耳さえ持たなかったではないか」という声も聞こえる。
 ホワイトバンドというものが流行っている。アフリカな� ��世界の貧困問題に関心があることを示すシンボルだという。「へえ、いいお考えで。で、あなたは次に何をやるんですかい?」とホワイトバンドをつけている人に問うてはいけないらしい。例えば,自分の生活レベルを引き下げて浮いた金をどこかに寄付するなんてことを期待してはいけないのと同様,欧州がアフリカなどの貧困対策に予算を振り向けるわけではない。アフリカ各国の債務の削減をしようと日本などを巻き込もうとするのがせいぜいである。アフリカを植民地にしてさんざん収奪してきた欧州が,債務を削減されて、ゆとりの出たアフリカで商売しようとの魂胆が見え透いている。
 民主主義なり人権なりの理念を高く掲げる欧州国家が,その理念は自分たちにしか適用されないという但し書が密かにあることを示す 事例には事欠かないが,最新の事例がフランスでの暴動であると見た方が良さそうだ。

民間開放のアナ……(11/19)
 パキスタンなど西アジアでの地震では、日干しレンガの壁の家が崩れて被害を拡大し,ビルでも耐震建築がなされていないため倒壊する惨事が珍しくない。世界でも有数の地震国である日本では,阪神大震災で多くのビルが地震に耐えられなかったことから建築基準法が改正され,少なくとも新設されるビルについては耐震性は高まったとされた。しかし、落とし穴があった。手抜き…。
 建築における手抜きの理由はコスト削減と工期短縮であると以前から言われてきたが,神戸で倒壊したり亀裂が入ったビルを見せつけられても,日本の建築に携わる人々の意識を変えることはでき なかった。問題は、手抜きがどこまで広がっているのかだ。構造計算書を偽造した姉歯建築設計事務所と偽造を素通りさせ建築確認をした民間検査機関「イーホームズ」だけのことなのか、それとも民間検査の実態とはこんなものなのか。さらには施工の現場では手抜きはどうなっているのか。信頼の上に成り立っている制度で,ずさんな実態が暴露されると,不安は広がるばかりだ。
 「民間でできることは民間で」と主張する人々がいる。親方日の丸の国鉄がJRに変わってサービスが良くなったと都会に住む人は言い、民営化を是とするが,JRになって都市住民には便利になっても,地方に住む人々にも便利になっているとは限らない。民間企業となれば,儲かるところに力を入れ,赤字の部分は切り捨てるだけ。つまり安全性など� ��けにつながらない部分にシワ寄せが行く。「民間でできること」には採算面で限界がある。
 民営化を論じる時には,受益と負担の線をどこで引くか、公共サービスのあり方を明確にする必要がある。赤字でも誰かがやらなければならないこと、採算重視ではできないことは公共サービスとしてやらざるを得まい。時代の変化とともに公共サービスのあり方も変化しよう。それを検証するところから民営化論議は始まる。赤字だからとむやみに民営化すると,採算重視で人減らしやサービス削減,果ては安全性など見えない部分が切り捨てられかねない。
 建築物の耐震性確保は、地震国・日本では必要だ。住む人ばかりではなく,地震で倒壊するかもしれない建物の周囲に住む人,さらには通行人として誰でもどこでも巻き添え� ��なる可能性がある。建築確認の民間開放のツケが、震度5程度で倒壊するビル群の誕生だったとすれば、一部の民間企業の利益と引き換えに、この社会は安全性を手放したことになる。これも自己責任とやらなのだろうか。


放送とネットの対立
……(11/6)
 楽天がTBSに経営統合を迫っているが、ここでも「放送とネットの融合」が大義名分の一つに挙げられている。ライブドアとフジテレビの騒動の時にも持ち出された、一見解りやすそうな「放送とネットの融合」、しかし、その中身は具体的には漠然としたままだ。
 その内容として例えば、(1)過去に放送したドラマなどを蓄積しておき,視聴者はいつでも呼び出して、それらを見ることができる,(2)ドラマなどで出演者が身につけている 衣服,小物などを即時的にネット通販で購入できる,(3)クイズ番組や討論番組などで視聴者参加がしやすくなるーーなどがいわれている。
 一方では、1)著作権料を払ってもペイするほど視聴者は過去のドラマなどを見たがっているのか、2)例えば,膨大なTBSの放送済み番組を楽天のサイトから見に行くことができるようになったとして、それほどの広範な需要があるのか、3)ドラマの途中で視聴者の関心が,出演者の衣服や小物に行って買い物ページに飛ぶような番組に魅力があるのか。番組連動の通販が可能だと言う前に、番組としての魅力が乏しければ視聴者が集まらない、4)電話,FAXなどで既に視聴者参加は可能だーーなどの反論が出ている。 
 そもそも、ながら視聴も含め受身で見ているテレビ視聴者と, 意識的に見に行くネット利用者を同列にとらえられるのかという点をよく考える必要がある。ネット利用者が見たいと思う番組に絞ってネットで提供するならビジネスとして成り立つかもしれないが、それがどういう番組なのかは誰も知らない。
 「放送とネットの融合」に関してマスコミに浮上していない問題が地上デジタル放送だ。光ファイバーなどが普及すれば,地上デジタル放送はネットで配信できるとされる。つまり、毎日の放送自体をネットでも同時に行うことができる。過去の番組ではなく,その日の番組で「商売」できるようになる。おそらく「放送とネットの融合」の効果は、そこから出て来るだろう。
 しかし、テレビ受像機の買い換えや大型タワーのような送信設備網の整備など膨大な需要と絡むので、許認 可事業のテレビ局(親会社の新聞社も含め)は地上デジタル放送には触れない。楽天なども、総務省を刺激することを恐れるのか,地上デジタル放送には触れない。
 百万円もあれば必要な機材は揃うので、ネット上に「放送局」を作るのは簡単だという。楽天の資力があれば毎日、ネット上に独自のコンテンツを流通させ,自前の「放送局」を作ることができただろう。ニュースは難しいかもしれないが、ドラマやトークショー,ライブなどの歌番組,旅番組,料理番組、パソコンの新製品や新車など各種の情報番組などを制作プロダクションと組んで流し,蓄積して行くことはできただろう。しかし,楽天もライブドアも自前の番組コンテンツを作ろうとは動かない。
 なぜ、ネット企業は放送局を欲しがるのか。本音は,放送 局の持つ社会的信用・信頼感を欲しがっているのかもしれない。株価頼みの「虚業」から「実業」へと軸足を移したがっている、つまり,ネット企業だからこそネットの世界内での商売の先行きが見えているとの見方だ。

2012年4月21日土曜日

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2012年4月19日木曜日

JoVE Video: ロックされた核酸のフローサイトメトリー、蛍光


蛍光 in situハイブリダイゼーション (FISH)が検出し、細胞環境内の特定の核酸配列をローカライズするために使用される強力な手法です。スループットを向上させるために、FISHは、個々の細胞の数千の標的核酸配列の検出を可能にするためにフローサイトメトリー(フロー- FISH)と組み合わせることができます。各セルは、それによってより強力な統計と分散分析を可能にする、独立した観察として扱われるため、結果として、フロー- FISHは、ライセート/アンサンブルベースの​​核酸の検出方法に比べて明確な利点を提供しています。これらの属性は、異なるアプリケーションの数のFISH、フロー- FISH法の使用を促していると、これらのメソッドのユーティリティが正常にウイルス増殖を監視し、テロメアの長さの決定1,2、細胞の同定と遺伝子発現3,4に示されている感染細胞5、および細菌群集の解析と列挙6。

伝統的に、FISH、フロー- FISH法の特異性はDNAのオリゴヌクレオチドプローブにより付与されています。しかし、最近、FISH、フロー- FISHプローブとしての核酸アナログによるDNAオリゴヌクレオチドプローブの交換が原因で、天然核酸7,8のためのこれらのアナログのより高い融解温度(T m)に各手法の感度と特異度の両方を増加している。ロックされた核酸(LNA)プローブは、DNAまたはRNA配列9,10を通してスパイクLNAヌクレオチドを含む核酸アナログの一種です。フロー- FISHと組み合わせることで、LNAプローブは以前に、従来のDNAプローブ7,11を上回ることが示されていると、正常5哺乳動物細胞内で真核生物のmRNAは12とウイルスRNAを検出するために使用されている。

ここでは、この機能を展開し、細菌の細胞内でRNAの特異的検出を可能にLNAフロー- FISH法を説明します。の( 図1)。具体的には、小さな非コード彼らは多くの重要な細胞プロセス13の主要な調節要素として機能するように発見されているとして、過去数年間でかなりの関心を集めている規制のRNA(sRNAを)の検出に興味を持っています。しかし、sRNAsと細菌細胞のsRNAを検出する課題を研究するために、限られたツールでは、一部の比較的小さなサイズ(通常は長さが50から300ヌクレオチド)とsRNA分子の低濃度だけでなく、作業の一般的な難しさに起因するあります細胞膜を変化させると小さな生物細胞と。この方法では、我々は細菌細胞の構造を維持し、LNAプローブの浸透だけでなく、低濃度sRNA( 図2)の特異的検出を可能にする信号増幅のステップを可能に固定し、permeabilzation条件について説明します。

1。 LNAプローブと実験計画

  1. あなたの転写sRNA / mRNAの逆補数であるか、またはそれらにカスタムデザインをお持ちの設計LNAプローブwww.exiqon.com 。カスタム設計のオプションを使用している場合は、シーケンスを知っている、ではなく、LNAスパイクパターンになります。の間のT mの増加にDNAまたはRNAオリゴヌクレオチド結果に各LNA残基のほか2〜10 ° C LNA - RNAハイブリダイゼーションの二重14。理想的には、設計したLNAプローブは、長さ20〜25ヌクレオチド(長いプローブを合成するより困難である)の間であると85から90の間のT m℃のRNAのハイブリダイゼーションが必要です。
  2. シーケンスを設計した後、BLASTの使用 / mRNAに特異的であることを確認したり、ローカルデータベースへのプローブ配列を比較する。
  3. LNAプローブをご注文の際は、LNAオリゴヌクレオチドの5'末端にビオチン- TEGの変更を追加。ビオチンは、ストレプトアビジン - 色素複合体とポストハイブリダイゼーション染色のために必要です。それは3にこの変更を追加することが可能である"必要があれば終わりが、5に加えて'末端には、安価で高収率になるはずです。
  4. 三ネガティブコントロール方法に含まれるべきである:(i)のLNAプローブはハイブリダイゼーション工程中に追加されていない'NO LNA"制御、LNAプローブはにハイブリダイズされている(II)"無色素"制御ターゲットsRNAがハイブリダイゼーションのイベントは順番に、存在しないまたは非発現sRNAをターゲットとLNAプローブを利用した制御を蛍光染色の欠如に起因する検出、および(iii)"非発現sRNA /発現"されていません非特異的ハイブリダイゼーションをモニターする。
  5. ここに特定のLNAプローブはsRNA CsrBを補完するものであり、配列5' -ビオチン- TEG - gTccAttTccCgtCctTagCagC - 3'(LNAのモノマーでいます)の文字を大文字。
  6. -20℃で10〜20μLのアリコートで50μg/ mLとし、店舗にヌクレアーゼフリー水で再懸濁し凍結乾燥LNAの受領、次の

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